DEPArray™ OncoSeek Panel 癌症基因定序套組

DEPArray™ LysePrep Kit可以一次裂解高達1500個細胞,釋放DNA,可以直接進行後續定序分析(例如Targeted PCR, NGS)。一步驟單管完成細胞裂解,無需轉移樣品或清洗,降低損失或稀釋DNA;細胞裂解後可直接使用在後續應用,高敏感度和正確性。

原廠介紹

產品優勢

  • 63種癌症相關基因的檢測
  • 可偵測基因突變模式SNV和CNA
  • 單管操作,只需4小時即可定序
  • 使用Illumina平台定序,高度保真
  • 最多可同時操作96個樣品
  • 只需少量的DNA
  • 60顆新鮮細胞 (~400pg DNA)
  • 100~300顆FFPE細胞 (660-1980pg DNA)
  • 樣品種類 : FFPE、新鮮組織、細胞株

可偵測基因列表

實驗數據

以基因HER2表現為例,乳癌的FFPE樣品,經過DEPArray將腫瘤細胞與基質細胞分離後進行定序,由75顆純粹腫瘤細胞顯示6.8倍HER2表現量。若是FFPE樣品不先分選細胞種類直接定序,只顯示<2倍的HER2表現量。

搭配DEPArray™ FFPE QC Kit (Silicon Biosystems, Product #DAFQC)可以定序前先確認樣品中的DNA質量是否適合定序,可以節省實驗成本。