Ampli1™ LowPass Kit 染色體非整倍體和拷貝數變異 建庫套組

Ampli1™ LowPass Kit 染色體非整倍體和拷貝數變異 建庫套組,接續Ampli1™ WGA Kit產物使用Ampli1™ LowPass Kit,可輕鬆完成測序前建庫,免除中間複雜的實驗流程,像是純化,去掉adaptor,再接合等步驟。
支援兩種定序平台:Ion Torrent™和Illumina®

Menarini Silicon Biosystems
接續Ampli1™ WGA Kit產物使用Ampli1™ LowPass Kit,可輕鬆完成測序前建庫,免除中間複雜的實驗流程,像是純化,去掉adaptor,再接合等步驟。

For Ion Torrent™

    產品特點

  • 多管單顆細胞經過標定步驟後,可混合成一管一起定序,並獲得穩定且真實,可重複的染色體非整倍體和拷貝數變更(CNA)數據結果
  • 一天即可完成實驗,全程6小時,操作2小時
  • 搭配多組試劑,最多可同時標定48個樣品
  • 每組試劑含16種標定物,共可進行80次反應

使用規範

適用機型Ion PGM™和Ion S5™
分子分析適合genome-wide copy-number alterations,不適合全基因組定序。
分子分析只適合接續Ampli1™ WGA Kit的產物

For Illumina®

    產品特點

  • 多管單顆細胞經過標定步驟後,可混合成一管一起定序,並獲得穩定且真實,可重複的染色體非整倍體和拷貝數變更(CNA)數據結果
  • 一天即可完成實驗,全程6小時,操作2小時
  • 最多可同時標定48個樣品
  • 每組試劑含48種標定物,共可進行48次反應

使用規範

適用機型Illumina MiSeq®, HiSeq® 1000/1500, 2000/2500, 3000/4000 和NovaSeq™
分子分析適合genome-wide copy-number alterations ,不適合全基因組定序。
分子分析只適合接續Ampli1™ WGA Kit的產物

實驗數據

Ampli1 LowPass Kit CTC CammpoAmpli1 LowPass Kit WBC Cammpo

Whole genome profile (chr 1-22) of a single CTC and a single WBC isolated with DEPArray Technology from a patient with lung adenocarcinoma. Ploidy values are indicated in the y-axis; in the x-axis, the alternation of different chromosomes are plotted with different colors. Copy number alterations in the CTC are indicated in red and blue.

全基因組整體的拷貝數確實變化完整呈現,與傳統aCGH方式相比,不需比較用控制組樣品,可偵測的位點不受探針設計限制,動態區間不受限。可忍受DNA質量較差的樣品。

For Ion Torrent™

產品貨號產品名稱產品數量
KI0053Set A1 Set
KI0052Set B1 Set
KI0051Set C1 Set

For Illumina®

產品貨號產品名稱產品數量
KI0123Set A1 Set
KI0125Set B1 Set
  1. Buson G et al, AACR 2016, “Scalable, rapid and affordable low-pass whole genome sequencing method for single-cell copy-number profiling on LM-PCR based WGA products”
  2. Ferrarini A et al, AACR 2016, “Precise copy-number profiling of single cells isolated from FFPE tissues by low-pass whole-genome sequencing”